網站架構圖
農村數位博物館由總館與子館構成，網站架構圖如下。
總館
總館的內容分成以下七個區塊：
- 關於臺灣農村：由臺灣農村的地貌、生態之多元特性，理解臺灣農村社會文化的多樣性價值。
- 漫步農村：「子館」的入口。
- 根源印象：環境․聚落、生產․消費、社會․文化三方面之精選照片集，展現臺灣農村的視覺美感，表現整體臺灣農村的代表形象。
- 用數字認識臺灣農村：藉統計圖表與問句的標題，讓數字說話，反映臺灣農村社會各方面的變遷。
- 檢視與遠望：剖析農村議題的線上展覽，目前有綠能發展與智慧農村兩大主題，探討農業的新趨勢。
- 農村紀事：以時間軸綜覽台灣農業歷程，分為歷史記憶與農業政策兩主題，可在事件序列中篩選查詢。
- 貢獻與參與：提供線上參與平台，邀請民眾一同參與，可上傳藏品、策劃展覽，讓農村數位博物館成為大家的線上博物館。
子館
子館的展示內容如下：
- 農村介紹：針對子館所涵蓋的區域，進行整體概述，包含地理位置、地形風貎、開庄歷史、生計活動/當地物產的特色、族群特色等。
- 地圖：呈現出子館所涵蓋的地理位置，地圖可手控縮小、放大，或拉曳至其他地區。
- 在地風貌：子館所在地有關土地、物產、人文三方面的代表圖，呈現在地的特色。
- 主題精選：部分子館具有主題精選，彙整各子館資料，分為找歷史、找景點、找影音、找記憶4類，推播時間、空間、多媒體等方面精選資料。
- 特色展覽：部份子館具有線上展覽，將田調資料經過數位與內容的轉譯，不受時空限制，具有互動性的操作機制，讓在地故事更生動立體。
- 博覽藏品：陳列子館的藏品，並有相關藏品連結，大多開放授權供閱覽者使用。
- 貢獻與參與：部分子館具有協作參與區塊，點選將進入開放平台，向民眾募集藏品，或將館藏進行內容與數位的轉譯製成展覽。